Uudet pohjoismaiset jalostusarvostelut on laskettu NTM-kokonaisjalostusarvolle, tuotos- ja rakenneominaisuuksille, hedelmällisyydelle, utareterveydelle, lypsettävyydelle, vuodolle ja luonteelle, sekä poikimaominaisuuksille, kasvulle, kestävyydelle ja sorkkaterveydelle. NAV laskee arvostelut roturyhmittäin:
Holsteinarvostelu, mukana olevat rodut: Tanskan holstein, Tanskan punainen holstein, Ruotsin holstein ja Suomen holstein. Suomen ayrshire ja suomenkarja ovat mukana holsteinarvostelussa vain tuomassa lisäinformaatiota.
Punaisten rotujen (RDC) arvostelu, mukana olevat rodut: Tanskan punainen (RDM), Ruotsin punakirjava rotu (SRB), Suomen ayrshire ja suomenkarja. Suomen holstein on mukana arvostelussa vain tuomassa lisäinformaatiota.
Jerseyarvostelu, mukana oleva rodut: Tanskan jersey ja Ruotsin jersey (vain tuotos- ja rakenneominaisuuksien arvostelu).
Aineiston poimintapäivämäärät
Arvostelussa käytetyn aineiston poimintapäivämäärät kansallisista tietokannoista on kerrottu taulukossa 1.
Taulukko 1. Aineiston poimintapäivämäärät
|
Ominaisuus
|
Tanska
|
Suomi
|
Ruotsi
|
|
Tuotosominaisuudet
|
20.12.2011
|
18.12.2011
|
15.12.2011
|
|
Rakenne, lypsettävyys, luonne, vuoto
|
29.12.2011
|
18.12.2011
|
12.12.2011
|
|
Hedelmällisyys
|
29.12.2011
|
18.12.2011
|
17.12.2011
|
|
Utareterveys, muut hoidot
|
29.12.2011
|
18.12.2011
|
17.12.2011
|
|
Poikimaominaisuudet
|
29.12.2011
|
18.12.2011
|
17.12.2011
|
|
Kestävyys
|
29.12.2011
|
18.12.2011
|
17.12.2011
|
|
Kasvu
|
30.12.2011
|
18.12.2011
|
14.12.2011
|
|
Sorkkaterveys
|
29.12.2011
|
18.12.2011
|
22.12.2011
|
Arvostelussa käytettävät genomitiedot
Arvostelussa käytettävät genomimääritykset poimittiin pohjoismaisesta SNP-tietokannasta 10. tammikuuta 2012. Genomisen arvostelumallin tietoja on täydennetty uusilla holsteinsonnien genotyyppitiedoilla Eurogenomics-maista. Genomisen arvostelumallin ns. referenssiryhmää on puolestaan täydennetty uusilla jälkeläisarvostelluilla sonneilla. Arvostelussa käytettävät Interbull-tiedot ovat puolestaan joulukuun 2011 Interbull-arvostelusta.
Arvostelussa tapahtuneet muutokset
Tuotosarvostelu
Tuotosarvostelusta on otettu käyttöön uudistettu versio. Laskennassa käytettävät perinnölliset tunnusluvut (mm. ominaisuuksien periytyvyydet ja korrelaatiot lypsykausien ja lypsykausien eri vaiheiden välillä) on päivitetty vastaamaan nykytilannetta. Myös eri maissa havaittavissa olevan erisuuruisen vaihtelun tasoitus tehdään nyt aiempaa paremmin. Arvostelussa tapahtuneet muutokset vaikuttavat eläinten saamiin arvosteluihin ja paremmuusjärjestykseen. Sonneille muutokset ovat pieniä, korrelaatiot aiemman ja uuden tuotosindeksin välillä vaihtelevat 0.98 ja 0.99 välillä. Lehmillä muutokset ovat suurempia, korrelaatiot aiemman ja uuden arvostelun välillä ovat noin 0.92-0.97. Suurimmat muutokset näkyvät suomalaisilla lehmillä (ayrshire ja holstein) sekä ruotsalaisella Jerseyllä. Syynä tähän ovat muita rotuja pienemmät karjakoot.
Taulukko 2. Aiemman ja uuden tuotosarvostelun perusteella laskettujen tuotosindeksien väliset korrelaatiot sonneilla.
|
|
Tanska
|
Ruotsi
|
Suomi
|
|
Holstein
|
0.99
|
0.99
|
0.98
|
|
RDC
|
0.99
|
0.99
|
0.96
|
|
Jersey
|
0.99
|
|
|
Taulukko 3. Aiemman ja uuden tuotosarvostelun perusteella laskettujen tuotosindeksien väliset korrelaatiot lehmillä
|
|
Tanska
|
Ruotsi
|
Suomi
|
|
Holstein
|
0.97
|
0.97
|
0.94
|
|
RDC
|
0.96
|
0.96
|
0.92
|
|
Jersey
|
0.97
|
0.93
|
|
Uudessa arvostelussa käytetyt ominaisuuksien periytymistasteet ovat aiempaa korkeampia, mikä laskee hieman vanhempien sonnien ja lehmien indeksejä suhteessa nuoriin eläimiin. Maiden väliset tasoerot pysyvät hyvin muuttumattomina, ainoastaan Ruotsin jerseyn taso putoaa suhteessa tanskalaiseen jerseyhin noin 2-3 indeksipistettä
Uudistuneella tuotosarvostelulla on vaikutusta myös tuotosominaisuuksien genomiarvosteluun.
Muutokset yhdistelmäindeksien ja NTM:n painoissa
Jersey
Muutokset tuotosindeksin sisältämien osaominaisuuksien painoissa (maito: rasva: valkuainen), aiemmin -3:4:9, nyt -3:5:8
Utarerakenteen paino NTM:ssä nostettiin 0.15:stä 0.20:een.
Tuotosindeksin paino NTM:ssä laskettiin 0.87:stä 0.82:een.
RDC
Lantion leveyden optimi runkoindeksin laskennassa muutettiin 6:sta 5:een.
Lypsettävyyden paino NTM:ssä nostettiin 0.06:sta 0.09:ään.
Taulukossa 4 on esitetty helmikuun 2012 arvostelussa käytetyt painot NTM:ää laskettaessa. Taulukossa 5 on kerrottu uuden/vanhan NTM:n ja yksittäisten ominaisuuksien väliset korrelaatiot punaisilla roduilla ja jerseyllä (holsteinilla ei muutoksia NTM:ssä). NTM-painotusten muutokset eivät aiheuta suuria muutoksia eläinten paremmuusjärjestykseen
Taulukko 4. NTM:n painokertoimet eri roduilla, helmikuu 2012
|
|
Holstein
|
RDC
|
Jersey
|
pun. Holstein (Tanska)
|
|
tuotos*
|
0.75/0.68
|
0.92/0.84
|
0.82/0.73
|
0.75/0.68
|
|
kasvu
|
0.06
|
0.00
|
0.00
|
0.11
|
|
hedelmällisyys
|
0.31
|
0.26
|
0.26
|
0.23
|
|
syntymäindeksi
|
0.15
|
0.14
|
0.06
|
0.17
|
|
poikimaindeksi
|
0.17
|
0.12
|
0.06
|
0.17
|
|
utareterveys
|
0.35
|
0.32
|
0.49
|
0.35
|
|
muut hoidot
|
0.11
|
0.12
|
0.04
|
0.12
|
|
runko
|
0.00
|
0.00
|
0.00
|
0.00
|
|
jalat
|
0.12
|
0.09
|
0.04
|
0.15
|
|
utare
|
0.18
|
0.32
|
0.20
|
0.24
|
|
lypsettävyys
|
0.08
|
0.09
|
0.10
|
0.08
|
|
luonne
|
0.03
|
0.03
|
0.03
|
0.03
|
|
kestävyys
|
0.11
|
0.08
|
0.12
|
0.11
|
|
sorkkaterveys
|
0.08
|
0.05
|
0.05
|
0.10
|
*paino sonneilla/paino lehmillä joilla omia mittalypsyhavaintoja
Taulukko 5. Yksittäisten ominaisuuksien korrelaatiot aiemman ja uuden NTM:n välillä. Laskettu vuosina 2004-2006 syntyneiden sonnien jalostusarvoista.
|
|
Jersey
|
RDC
|
|
|
vanha NTM
|
helmikuu 2012 NTM
|
vanha NTM
|
helmikuu 2012 NTM
|
|
tuotos*
|
0.66
|
0.61
|
0.63
|
0.62
|
|
kasvu
|
-0.09
|
-0.10
|
0.04
|
0.03
|
|
hedelmällisyys
|
0.48
|
0.49
|
0.21
|
0.20
|
|
syntymäindeksi
|
0.12
|
0.11
|
0.18
|
0.18
|
|
poikimaindeksi
|
0.21
|
0.21
|
0.20
|
0.19
|
|
utareterveys
|
0.40
|
0.44
|
0.37
|
0.36
|
|
muut hoidot
|
0.24
|
0.24
|
0.25
|
0.24
|
|
runko
|
0.09
|
0.07
|
0.04
|
0.04
|
|
jalat
|
0.17
|
0.19
|
0.16
|
0.16
|
|
utare
|
0.03
|
0.10
|
0.28
|
0.29
|
|
lypsettävyys
|
0.03
|
0.04
|
0.17
|
0.21
|
|
luonne
|
-0.02
|
-0.02
|
0.17
|
0.18
|
|
kestävyys
|
0.41
|
0.45
|
0.47
|
0.47
|
|
sorkkaterveys
|
0.10
|
0.11
|
0.01
|
0.01
|
Vertailuryhmä
Sonnien ja lehmien jalostusarvot ilmaistaan suhteellisina indekseinä, jolloin kaikkia eläimiä verrataan samaan vertailuryhmään. Tämän arvostelun vertailuryhmän (joiden indeksien keskiarvo on 100) muodostavat 02.02.2007-02.02.2009 välisenä aikana syntyneet lehmät
Genomitietoa sisältävät indeksit
NAVin arvostelussa hyödynnetään perinteisten tietojen lisäksi yksittäisten eläinten genomitestitietoja. Englannin kielellä tällaisista arvosteluista saatavia indeksejä kutsutaan nimellä ”Genomic Enhanced Breeding Values” eli GEBV. Suomenkielinen vastine voisi olla genomitietoa sisältävät indeksit tai genomi-indeksit. Aluksi genomitietoja hyödynnetään NTM:ssä ja sen sisältämissä ominaisuuksissa sonneilla niissä ominaisuuksissa, joissa niillä ei vielä ole tytärinformaatiota. Jos sonnilla on jo tytärinformaatiota kyseisessä ominaisuudessa (esim. tuotosarvostelu), niin silloin sonnin oma genomitieto ei sisälly sen indeksiin. Genomitestattujen hiehojen indeksien laskennassa on myös käytetty genomitietoja, kuten myös lehmillä ominaisuuksissa, joissa muuten indeksit laskettaisiin odotusarvojen kautta.
Taulukossa 6 on kuvattu mille genomitestatuille eläimille julkistetaan GEBV:t ja mille eläimille perinteiset jalostusarvot (EBV). EBV poikkeaa GEBV:stä siinä, että se ei sisällä yksilön omaa genomitietoa.
Taulukko 6. Genomitietoa sisältävien indeksien (GEBV) julkaisu eri eläinryhmillä 2.2.2012 arvostelussa
|
Eläinryhmä
|
Status
|
julkistettava indeksi
|
|
genomitestattu sonni
|
nuorsonni, jolla ei vielä jälkeläisiä
|
karsittu
|
indeksejä ei julkaista
|
|
keinosiemennyssonnit
|
GEBV jos sonni on vähintään 20 kk ikäinen arvosteluhetkellä
|
|
sonni, jolla on jo jälkeläisiä
|
keinosiemennyssonnit
|
EBV
|
|
tuontisonnit
|
Interbull-arvostelu niissä ominaisuuksissa, joissa se on saatavissa. GEBV jos perinteistä indeksiä ei ole käytössä
|
|
genomitestattu hieho tai lehmä
|
hieho
|
GEBV
|
|
lehmä
|
GEBV ominaisuuksissa, joissa lehmien indeksi on odotusarvo (muut hoidot, hedelmällisyys, poikimaominaisuudet)
|
Seuraava kehitysvaihe genomitietojen hyödyntämisessä indeksilaskennassa pitää sisällään seuraavaa:
· Genomitietojen käyttö sonneilla, joilla on jo tytärinformaatiota arvostelussa
· Genomitietojen käyttö lehmillä, joilla on jo omia mittauksia ja havaintoja arvosteluaineistossa
Arvosteluvarmuus
Genomisen tiedon avulla laskettujen indeksien arvosteluvarmuudet vaihtelevat ominaisuuksittain ja roduittain.Taulukossa 7 kerrotaan yleinen vaihteluväli arvosteluvarmuudessa eri roduilla, kun arvostelussa on käytetty eläimen suku- ja genomitietoa.
Taulukko 7. Genomiseen tietoon perustuva arvosteluvarmuus
|
|
arvosteluvarmuus
|
|
RDC
|
0.30-0.40
|
|
Holstein
|
0.40-0.50
|
|
Jersey
|
0.20-0.30
|
NTM:n julkaiseminen
Sonnin NTM julkaistaan, jos sonnilla on virallinen arvostelu (joko NAV-arvostelussa tai Interbullin arvostelussa) tuotosominaisuuksissa, rakenteessa sekä utareterveydessä. Virallisella arvostelulla tarkoitetaan sitä, että sonni täyttää kyseisen ominaisuuden arvosteluvarmuuskriteerit. NTM:ää laskettaessa käytetään ensisijaisesti ominaisuuden NAV-arvostelua, ulkomaiselle sonnille käytetään NAV-arvostelun puuttuessa kyseisen ominaisuuden Interbull-arvostelua. Mikäli sonnilla ei ole jossain ominaisuudessa NAV- tai Interbull-arvostelua, lasketaan sonnille suvun mukainen odotusarvo.
NAV-arvostelujen lukumäärä ja aikataulu
NAV laskee vuosittain neljä arvostelua. Aikataulu on sellainen, että NAV pystyy toimittamaan mahdollisimman tuoreet jalostusarvot Interbullin kansainväliseen arvosteluun. Oheisessa taulukossa (taulukko 8) on kerrottu NAVin ja Interbull-arvostelujen julkaisupäivät vuonna 2012. Rutiiniarvostelujen lisäksi NAV laskee vuosittain neljä ylimääräistä arvostelua, joissa käytetään uusia genomitestituloksia sonneilta, lehmiltä ja hiehoilta. Ylimääräisten arvostelut tehdään 15.9, 15.12, 15.3 ja 15.6. Ylimääräisten arvostelujen jälkeen lehmien ja hiehojen arvostelutulokset päivitetään tietokantaan.
Taulukko 8. NAV- ja Interbull-arvostelujen julkaisupäivät vuonna 2011/2012. Tummennetulla merkityt NAVin arvostelut toimitetaan seuraavaan Interbull-arvosteluun
|
|
2012
|
|
kuukausi
|
NAV
|
Interbull
|
|
tammikuu 2012
|
|
|
|
helmikuu 2012
|
2
|
|
|
maaliskuu 2012
|
|
|
|
huhtikuu 2012
|
|
3
|
|
toukokuu 2012
|
2
|
|
|
elokuu 2012
|
14
|
14
|
|
syyskuu 2012
|
|
|
|
lokakuu 2012
|
|
|
|
marraskuu 2012
|
2
|
|
|
joulukuu 2012
|
|
4
|
Lisätietoja pohjoismaisesta arvostelusta löytyy:
NAVin kotisivut: www.nordicebv.info
Yhteyshenkilö: Gert Pedersen Aamand, Puh. +45 87405288 gap@vfl.dk,
Tanska: Yhteyshenkilö: Ulrik Sander Nielsen, Dansk Kvaeg, Puh. +45 87405289, usn@vfl.dk
Ruotsi: : www.svenskmjolk.se
Yhteyshenkilö: Jan-Åke Eriksson, Svensk Mjölk, Puh. +46 08-790 58 67
jan.eriksson@svenskmjolk.se
Suomi: www.faba.fi
Yhteyshenkilö: Jukka Pösö, Faba, Puh. +358-(0)207472071 jukka.poso@faba.fi