Log på Forside
Uutisia – NAVin rutiiniarvostelu 2. marraskuuta 2011 

Uudet pohjoismaiset jalostusarvostelut on laskettu NTM-kokonaisjalostusarvolle, tuotos- ja rakenneominaisuuksille, hedelmällisyydelle, utareterveydelle, lypsettävyydelle, vuodolle ja luonteelle, sekä poikimaominaisuuksille, kasvulle, kestävyydelle ja sorkkaterveydelle. NAV laskee arvostelut roturyhmittäin:

Holsteinarvostelu,  mukana olevat rodut: Tanskan holstein, Tanskan punainen holstein, Ruotsin holstein ja Suomen holstein. Suomen ayrshire ja suomenkarja ovat mukana holsteinarvostelussa vain tuomassa lisäinformaatiota.

Punaisten rotujen arvostelu, mukana olevat rodut: Tanskan punainen (RDM), Ruotsin punakirjava rotu (SRB), Suomen ayrshire ja suomenkarja.  Suomen holstein on mukana arvostelussa vain tuomassa lisäinformaatiota.

Jerseyarvostelu, mukana oleva rodut: Tanskan jersey ja Ruotsin jersey (vain tuotos- ja rakenneominaisuuksien arvostelu).

Aineiston poimintapäivämäärät

Arvostelussa käytetyn aineiston poimintapäivämäärät kansallisista tietokannoista on kerrottu taulukossa 1.

Taulukko 1. Aineiston poimintapäivämäärät

Ominaisuus

Tanska

Suomi

Ruotsi

Tuotosominaisuudet

21.09.2011

18.09.2011

15.09.2011

Rakenne, lypsettävyys, luonne, vuoto

30.09.2011

18.09.2011

12.09.2011

Hedelmällisyys

30.09.2011

18.09.2011

17.09.2011

Utareterveys, muut hoidot

30.09.2011

18.09.2011

17.09.2011

Poikimaominaisuudet

30.09.2011

18.09.2011

17.09.2011

Kestävyys

30.09.2011

18.09.2011

17.09.2011

Kasvu

30.09.2011

18.09.2011

17.09.2011

Sorkkaterveys

30.09.2011

18.09.2011

27.09.2011

Arvostelussa käytettävät genomitiedot

Arvostelussa käytettävät genomimääritykset poimittiin pohjoismaisesta SNP-tietokannasta 19. lokakuuta 2011. Arvostelussa käytettävät Interbull-tiedot ovat puolestaan elokuun 2011 Interbull-arvostelusta.

Katsaus arvosteluihin

Genomitietojen hyväksikäyttö

Genomitietoja käytettiin ensimmäistä kertaa Tanskan punaisen holsteinin arvostelussa. Mukana ovat kaikki NTM:n sisältämät ominaisuudet sekä kaikki rakenneominaisuudet. Tanskan punaisen holsteinin genomiarvostelu pohjautuu NAVin holstein-genomimalliin.

Sorkkaterveys

Sorkkaterveysarvostelussa on korjattu Suomen sorkkaterveysaineiston käsittelyä. Tämä lisää Suomen aineistoa noin 55 000 sorkkaterveyshavainnolla. Suomalaisten sonnien indeksimuutokset elokuun arvosteluun verrattuna johtuvat nimenomaan siitä, että niillä on arvostelussa nyt enemmän tytärhavaintoja.

Vertailuryhmä

Sonnien ja lehmien jalostusarvot ilmaistaan suhteellisina indekseinä, jolloin kaikkia eläimiä verrataan samaan vertailuryhmään. Tämän arvostelun vertailuryhmän (joiden indeksien keskiarvo on 100) muodostavat 02.11.2006-02.11.2008 välisenä aikana syntyneet lehmät

Genomitietoa sisältävät indeksit

NAVin arvostelussa hyödynnetään perinteisten tietojen lisäksi yksittäisten eläinten genomitestitietoja. Englannin kielellä tällaisista arvosteluista saatavia indeksejä kutsutaan nimellä ”Genomic Enhanced Breeding Values” eli GEBV. Suomenkielinen vastine voisi olla genomitietoa sisältävät indeksit tai genomi-indeksit.  Aluksi genomitietoja hyödynnetään NTM:ssä ja sen sisältämissä ominaisuuksissa sonneilla niissä ominaisuuksissa, joissa niillä ei vielä ole tytärinformaatiota. Jos sonnilla on jo tytärinformaatiota kyseisessä ominaisuudessa (esim. tuotosarvostelu), niin silloin sonnin oma genomitieto ei sisälly sen indeksiin. Genomitestattujen hiehojen indeksien laskennassa on myös käytetty genomitietoja, kuten myös lehmillä ominaisuuksissa, joissa muuten indeksit laskettaisiin odotusarvojen kautta.

Taulukossa 2 on kuvattu mille genomitestatuille eläimille julkistetaan GEBV:t ja mille eläimille perinteiset jalostusarvot (EBV). EBV poikkeaa GEBV:stä siinä, että se ei sisällä yksilön omaa genomitietoa.

Taulukko 2. Genomitietoa sisältävien indeksien (GEBV) julkaisu eri eläinryhmillä 2.11.2011 arvostelussa 

Eläinryhmä

Status

julkistettava indeksi

genomitestattu sonni

nuorsonni, jolla ei vielä jälkeläisiä

karsittu

indeksejä ei julkaista

keinosiemennyssonnit

GEBV jos sonni on vähintään 20 kk ikäinen arvosteluhetkellä

sonni, jolla on jo jälkeläisiä

keinosiemennyssonnit

EBV

tuontisonnit

Interbull-arvostelu niissä ominaisuuksissa, joissa se on saatavissa. GEBV jos perinteistä indeksiä ei ole käytössä

genomitestattu hieho tai lehmä

hieho

GEBV

lehmä

GEBV ominaisuuksissa, joissa lehmien indeksi on odotusarvo (muut hoidot, hedelmällisyys, poikimaominaisuudet)

Seuraava kehitysvaihe genomitietojen hyödyntämisessä indeksilaskennassa pitää sisällään seuraavaa:

·    Genomitietojen käyttö sonneilla, joilla on jo tytärinformaatiota arvostelussa
·    Genomitietojen käyttö lehmillä, joilla on jo omia mittauksia ja havaintoja arvosteluaineistossa

Arvosteluvarmuus

Genomisen tiedon avulla laskettujen indeksien arvosteluvarmuudet vaihtelevat ominaisuuksittain ja roduittain.Taulukossa 3 kerrotaan yleinen vaihteluväli arvosteluvarmuudessa eri roduilla, kun arvostelussa on käytetty eläimen suku- ja genomitietoa.

Taulukko 3. Genomiseen tietoon perustuva arvosteluvarmuus

 

arvosteluvarmuus

RDC

0.30-0.40

Holstein

0.40-0.50

Jersey

0.20-0.30

NTM:n julkaiseminen

Sonnin NTM julkaistaan, jos sonnilla on virallinen arvostelu (joko NAV-arvostelussa tai Interbullin arvostelussa) tuotosominaisuuksissa, rakenteessa sekä utareterveydessä. Virallisella arvostelulla tarkoitetaan sitä, että sonni täyttää kyseisen ominaisuuden arvosteluvarmuuskriteerit. NTM:ää laskettaessa käytetään ensisijaisesti ominaisuuden NAV-arvostelua, ulkomaiselle sonnille käytetään NAV-arvostelun puuttuessa kyseisen ominaisuuden Interbull-arvostelua. Mikäli sonnilla ei ole jossain ominaisuudessa NAV- tai Interbull-arvostelua, lasketaan sonnille suvun mukainen odotusarvo. 

NAV-arvostelujen lukumäärä ja aikataulu

NAV laskee vuosittain neljä arvostelua. Aikataulu on sellainen, että NAV pystyy toimittamaan mahdollisimman tuoreet jalostusarvot Interbullin kansainväliseen arvosteluun. Oheisessa taulukossa (taulukko 4) on kerrottu NAVin ja Interbull-arvostelujen julkaisupäivät vuonna 2011/2012. Rutiiniarvostelujen lisäksi NAV laskee vuosittain neljä ylimääräistä arvostelua, joissa käytetään uusia genomitestituloksia sonneilta, lehmiltä ja hiehoilta. Ylimääräisten arvostelut tehdään 15.9, 15.12, 15.3 ja 15.6. Ylimääräisten arvostelujen jälkeen lehmien ja hiehojen arvostelutulokset päivitetään tietokantaan.

Taulukko 4. NAV- ja Interbull-arvostelujen julkaisupäivät vuonna 2011/2012. Tummennetulla merkityt NAVin arvostelut toimitetaan seuraavaan Interbull-arvosteluun

 

2011/2012

kuukausi

NAV

Interbull

marraskuu 2011

2

 

joulukuu 2011

6

tammikuu 2012

 

 

helmikuu 2012

2

 

maaliskuu 2012

 

huhtikuu 2012

 

3

toukokuu 2012

2

 

elokuu 2012

14

14

syyskuu 2012

 

 

lokakuu 2012

 

 

marraskuu 2012

2

 

joulukuu 2012

4

Lisätietoja pohjoismaisesta arvostelusta löytyy:

NAVin kotisivut: www.nordicebv.info
Yhteyshenkilö: Gert Pedersen Aamand, Puh. +45 87405288 gap@landscentret.dk,

Tanska: www.landscentret.dk/nav
Yhteyshenkilö: Ulrik Sander Nielsen, Dansk Kvaeg, Puh. +45 87405289, usn@landscentret.dk

Ruotsi: : www.svenskmjolk.se
Yhteyshenkilö: Jan-Åke Eriksson, Svensk Mjölk, Puh. +46 08-790 58 67 jan.eriksson@svenskmjolk.se

Suomi: www.faba.fi
Yhteyshenkilö: Jukka Pösö, Faba, Puh. +358-(0)207472071 jukka.poso@faba.fi

Nordic Cattle Genetic Evaluation