Log på Forside
Uutisia - NAVin rutiiniarvostelu - 2. toukokuuta 2011 

Uudet pohjoismaiset jalostusarvostelut on laskettu NTM-kokonaisjalostusarvolle, tuotos- ja rakenneominaisuuksille, hedelmällisyydelle, utareterveydelle, lypsettävyydelle, vuodolle ja luonteelle, sekä poikimaominaisuuksille, kasvulle, kestävyydelle ja sorkkaterveydelle. NAV laskee arvostelut roturyhmittäin:

Holsteinarvostelu,  mukana olevat rodut: Tanskan holstein, Tanskan punainen holstein, Ruotsin holstein ja Suomen holstein. Suomen ayrshire ja suomenkarja ovat mukana holsteinarvostelussa vain tuomassa lisäinformaatiota.

Punaisten rotujen arvostelu, mukana olevat rodut: Tanskan punainen (RDM), Ruotsin punakirjava rotu (SRB), Suomen ayrshire ja suomenkarja.  Suomen holstein on mukana arvostelussa vain tuomassa lisäinformaatiota.

Jerseyarvostelu, mukana oleva rodut: Tanskan jersey ja Ruotsin jersey (vain tuotos- ja rakenneominaisuuksien arvostelu).

Aineiston poimintapäivämäärät
Arvostelussa käytetyn aineiston poimintapäivämäärät kansallisista tietokannoista on kerrottu taulukossa 1.

Taulukko 1. Aineiston poimintapäivämäärät

Ominaisuus

Tanska

Suomi

Ruotsi

Tuotosominaisuudet

 22.03.2011

20.03.2011

17.03.2011

Rakenne, lypsettävyys, luonne, vuoto

23.03.2011

20.03.2011

21.03.2011

Hedelmällisyys

23.03.2011

20.03.2011

19.03.2011

Utareterveys, muut hoidot

23.03.2011

20.03.2011

19.03.2011

Poikimaominaisuudet

23.03.2011

20.03.2011

19.03.2011

Kestävyys

23.03.2011

20.03.2011

19.03.2011

Kasvu

23.03.2011

20.03.2011

15.03.2011

Sorkkaterveys

23.03.2011

20.03.2011

29.03.2011

Katsaus arvosteluihin
Sorkkaterveys
NAV on laskenut ensimmäistä kertaa pohjoismaiset indeksit lypsyrotuisten sonnien sorkkaterveydelle.Tarkoituksena on lisätä sorkkaterveysindeksi myös NTM-kokonaisjalostusarvoon elokuun 2011 arvostelun yhteydessä.   

Genomitietojen hyväksikäyttö jalostusarvostelussa
NAV-arvostelussa on käytetty ensimmäistä kertaa hyödyksi sonnien ja lehmien genomitietoja perinteisen jalostusarvosteluaineiston ohella NTM-kokonaisjalostusarvossa ja sen sisältämissä ominaisuuksissa. Sonneilla ja lehmillä on siis edelleen kussakin ominaisuudessa vain yksi jalostusarvon ennuste (indeksi), mutta osalla eläimistä sen laskemisessa on käytetty uutta tietolähdettä eli genomitietoja.

Muut ominaisuudet
Muiden ominaisuuksien arvostelussa ei tapahtunut muutoksia.

Vertailuryhmä
Sonnien ja lehmien jalostusarvot ilmaistaan suhteellisina indekseinä, jolloin kaikkia eläimiä verrataan samaan vertailuryhmään. Tämän arvostelun vertailuryhmän (joiden indeksien keskiarvo on 100) muodostavat 02.05.2006-02.05.2008 välisenä aikana syntyneet lehmät.

Taulukko 2. Vertailuryhmät sonnien ja lehmien indeksien muodostamisessa

ominaisuus

vertailuryhmän muodostavat

tuotos, rakenneominaisuudet, kestävyys, utareterveys, lypsettävyys, luonne, vuoto ja kasvu*, hedelmällisyys, poikimaominaisuudet, muut hoidot, sorkkaterveys

lehmät, joiden syntymäaika on 02.05.2006 -02.05.2008

 

 

*kyseisenä ajanjaksona syntyneet sonnivasikat

Sorkkaterveys
NAV julkaisi ensimmäistä kertaa sorkkaterveysarvostelun. Arvostelumalli on niin kutsuttu lineaarinen monenominaisuuden eläinmalli.  

Arvostelussa käytetään tietoja seitsemästä eri sorkkaterveysominaisuudesta kolmelta ensimmäiseltä lypsykaudelta. Taulukossa 3 on lueteltu sorkkaterveysarvostelun sisältämät tiedot Suomesta, Ruotsista ja Tanskasta.

Taulukko 3. Sorkkaterveysarvostelun hyödyntämät sorkkaterveystiedot eri Pohjoismaista.

ominaisuus

Tanska

Suomi

Ruotsi

Dermatitis (DE)

Digital de + spaltebetaendelse

Sorkkavälin ihon tulehdus + Sorkka-alueen ihotulehdus

Digital de + klövspalteksem

Heel Horn Erosion (HH)

Balleråd

Kantasyöpymä

Klövröta

Sole Haemorrhage (SH)

Såleblödning

Vertymiä anturassa

Sulblödning

Sole Ulcer (SU)

Sålesår

Anturahaavauma + Valkoviivan paise

klövsulesår

Cork screw claws (CSC)

Proptraekker klov

Sorkkakiertymä

Korkskruvsklöv

Skin Proliferation (SP)

Nydannelse+Digital vorte

Sorkkavälin liikakasvu+Sorkkasyylä

Limax+vårta

White line separation+ double sole (WLS)

Hul vaeg+ dobbelt sål

Valkoviivan repeämä, kaksoispohja

Hålvägg+ dubbelsula

Sorkkahoitotietoja käytetään poikimisesta aina seuraavaan poikimiseen saakka tai maksimissaan 430 päivää poikimisen jälkeen. Kultakin lypsykaudelta huomioidaan kolme sorkkahoitotapahtumaa. Hoitojen välillä tulee olla vähintään 12 viikkoa

Taulukko 4. Sorkkahoitojen lukumäärä roduittain ja maittain välillä 01.04.2010-31.03.2011.

 

RDC

Holstein

Jersey

Ruotsi

68,206

77,102

1,303

Suomi

12,012

6,598

-

Tanska

13,271

148,751

23,319

Taulukko 5. Arvostelussa käytettyjä geneettisiä tunnuslukuja

Ominaisuus

periytysmisaste – lypsykaudet 1-3

lypsykausien väliset geneettiset korrelaatiot

sorkkavälin ihotulehdus (DE)

0.04-0.05

0.94-0.99

kantasyöpymä (HH)

0.05-0.06

0.84-0.98

vertymiä anturassa (SH)

0.03-0.04

0.82-0.90

anturahaavauma (SU)

0.02-0.02

0.79-0.91

sorkkakiertymä (CSC)

0.02-0.06

0.66-0.98

sorkkavälin liikakasvu (SP)

0.04-0.05

0.88-0.97

valkoviivan repeämä + kaksoispohja (WLS)

0.01-0.02

0.71-0.88

Sorkkaterveysominaisuudet voidaan ryhmitellä kahteen perinnöllisesti erityyppiseen ryhmään:  Ryhmä 1(sorkkavälin ihotulehdus, sorkkavälin liikakasvu, kantasyöpymä),  Ryhmä 2 (vertymiä anturassa, anturahaavauma, sorkkakiertymä, valkoviivan repeämä+ kaksoispohja). Sorkkaterveysominaisuuksien geneettiset korrelaatiot ryhmän sisällä vaihtelevat 0.5:n ja 0.9:n välillä, ryhmien väliset korrelaatiot ovat lähellä nollaa.

Kullekin sorkkaterveysominaisuudelle lasketaan jalostusarvon ennuste käyttäen tietoja kolmelta ensimmäiseltä lypsykaudelta. Yksittäiset sorkkaterveysominaisuudet yhdistetään yhdeksi sorkkaterveysindeksiksi. Yksittäisten ominaisuuksien painotus sorkkaterveysindeksissä on kerrottu taulukossa 6. Yksittäisistä ominaisuuksista eniten painoa saa anturahaavauma (DE).

Taulukko 6. Yksittäisten sorkkaterveysominaisuuksien suhteelliset painot yhdistetyssä sorkkaterveysindeksissä

 

Holstein

RDC

Jersey

anturahaavauma

1.000

1.000

1.000

vertymiä anturassa

0.134

0.134

0.136

kantasyöpymä

0.215

0.215

0.219

sorkkavälin ihotulehdus

0.215

0.215

0.219

sorkkavälin liikakasvu

0.394

0.394

0.363

valkoviivan repeämä

0.134

0.134

0.136

sorkkakiertymä

0.149

0.149

0.193

Julkaistavaan sorkkaterveysindeksin vaaditaan vähintään 40%. Koska sorkkaterveystietoja on käytettävissä vasta lyhyeltä ajanjaksolta, on indeksien standardoinnissa käytettävä hajonta laskettu HOL ja RDC-sonneilta, joiden arvosteluvarmuus on 40%. Jerseysonneilta on edellytetty 30% arvosteluvarmuutta, jotta saadaan hajonta laskettua riittävän isosta sonnijoukosta.

Taulukko 7. Yksittäisten sorkkaterveysominaisuuksien ja yhdistetyn sorkkaterveysindeksin väliset korrrelaatiot

 

Holstein

RDC

Jersey

anturahaavauma

0.90

0.79

0.84

vertymiä anturassa

0.66

0.83

0.74

kantasyöpymä

0.62

0.76

0.77

sorkkavälin ihotulehdus

0.50

0.63

0.62

sorkkavälin liikakasvu

0.41

0.41

0.56

valkoviivan repeämä

0.78

0.53

0.66

sorkkakiertymä

0.57

0.34

0.68

Korrelaatio aiemman Ruotsissa käytössä olleen sorkkaterveysindeksin ja uuden pohjoismaisen sorkkaterveysindeksin välillä on noin 80 %. Suurin ero arvostelujen välillä on se, että uusi pohjoismainen arvostelu hyödyntää hoitotietoja kolmelta ensimmäiseltä lypsykaudelta. Ruotsin aiempi arvostelu otti huomioon tiedot vain ensikkolypsykaudelta. Myös arvosteltujen sorkkaterveysominaisuuksien lukumäärä nousi Ruotsin aiemmasta neljästä nyt seitsemään.

Sorkkaterveysindeksi tullaan ottamaan mukaan NTM-kokonaisjalostusarvoon elokuun 2011 arvostelussa.

Genomitietoa sisältävät indeksit
NAV on julkaissut ensimmäistä kertaa jalostusarvostelun, jossa on hyödynnetty perinteisten tietojen lisäksi yksittäisten eläinten genomitestitietoja. Englannin kielellä tällaisista arvosteluista saatavia indeksejä kutsutaan nimellä ”Genomic Enhanced Breeding Values” eli GEBV. Suomenkielinen vastine voisi olla genomitietoa sisältävät indeksit tai genomi-indeksit.  Aluksi genomitietoja hyödynnetään NTM:ssä ja sen sisältämissä ominaisuuksissa sonneilla niissä ominaisuuksissa, joissa niillä ei vielä ole tytärinformaatiota. Jos sonnilla on jo tytärinformaatiota kyseisessä ominaisuudessa (esim. tuotosarvostelu), niin silloin sonnin oma genomitieto ei sisälly sen indeksiin. Genomitestattujen hiehojen indeksien laskennassa on myös käytetty genomitietoja, kuten myös lehmillä ominaisuuksissa, joissa muuten indeksit laskettaisiin odotusarvojen kautta.

Taulukossa 8 on kuvattu mille genomitestatuille eläimille julkistetaan GEBV:t ja mille eläimille perinteiset jalostusarvot (EBV). EBV poikkeaa GEBV:stä siinä, että se ei sisällä yksilön omaa genomitietoa.

Taulukko 8. Genomitietoa sisältävien indeksien (GEBV) julkaisu eri eläinryhmillä 2.5.2011 arvostelussa  

Eläinryhmä

Status

julkistettava indeksi

genomitestattu sonni

nuorsonni, jolla ei vielä jälkeläisiä

karsittu

indeksejä ei julkaista

keinosiemennyssonnit

GEBV jos sonni on vähintään 20 kk ikäinen arvosteluhetkellä

sonni, jolla on jo jälkeläisiä

keinosiemennyssonnit

EBV

tuontisonnit

Interbull-arvostelu niissä ominaisuuksissa, joissa se on saatavissa. GEBV jos perinteistä indeksiä ei ole käytössä

genomitestattu hieho tai lehmä

hieho

GEBV

lehmä

GEBV ominaisuuksissa, joissa lehmien indeksi on odotusarvo (muut hoidot, hedelmällisyys, poikimaominaisuudet)

Punaisen holsteinin (DRH) osalta genomitietoja ei vielä ole otettu mukaan indeksilaskentaan. Se tapahtuu lähitulevaisuudessa. Seuraava vaihe genomitietojen hyödyntämisessä indeksilaskennassa pitää sisällään seuraavaa:

·    Genomitietojen hyväksikäyttö punaisella holsteinilla

·    Genomitietojen hyödyntäminen kaikissa yksittäisissä ominaisuuksissa

·    Genomitietojen käyttö sonneilla, joilla on jo tytärinformaatiota arvostelussa

·    Genomitietojen käyttö lehmillä, joilla on jo omia mittauksia ja havaintoja arvosteluaineistossa 

Arvosteluvarmuus
Genomisen tiedon avulla laskettujen indeksien arvosteluvarmuudet vaihtelevat ominaisuuksittain ja roduittain.Taulukossa 9 kerrotaan yleinen vaihteluväli arvosteluvarmuudessa eri roduilla, kun arvostelussa on käytetty eläimen suku- ja genomitietoa..

Taulukko 9. Genomiseen tietoon perustuva arvosteluvarmuus

 

arvosteluvarmuus

RDC

0.30-0.40

Holstein

0.40-0.50

Jersey

0.20-0.30

NTM:n julkaiseminen
Sonnin NTM julkaistaan, jos sonnilla on virallinen arvostelu (joko NAV-arvostelussa tai Interbullin arvostelussa) tuotosominaisuuksissa, rakenteessa sekä utareterveydessä. Virallisella arvostelulla tarkoitetaan sitä, että sonni täyttää kyseisen ominaisuuden arvosteluvarmuuskriteerit. NTM:ää laskettaessa käytetään ensisijaisesti ominaisuuden NAV-arvostelua, ulkomaiselle sonnille käytetään NAV-arvostelun puuttuessa kyseisen ominaisuuden Interbull-arvostelua. Mikäli sonnilla ei ole jossain ominaisuudessa NAV- tai Interbull-arvostelua, lasketaan sonnille suvun mukainen odotusarvo.

NAV-arvostelujen lukumäärä ja aikataulu
NAV laskee vuosittain neljä arvostelua. Aikataulu on sellainen, että NAV pystyy toimittamaan mahdollisimman tuoreet jalostusarvot Interbullin kansainväliseen arvosteluun. Oheisessa taulukossa (taulukko 10) on kerrottu NAVin ja Interbull-arvostelujen julkaisupäivät vuonna 2011.

Taulukko 10. NAV- ja Interbull-arvostelujen julkaisupäivät vuonna 2011. Tummennetulla merkityt NAVin arvostelut toimitetaan seuraavaan Interbull-arvosteluun

 

2011

kuukausi

NAV

Interbull

tammikuu 2011

 

 

helmikuu 2011

2

 

maaliskuu 2011

 

huhtikuu 2011

 

5

toukokuu 2011

2

 

elokuu 2011

9

9

syyskuu 2011

 

 

lokakuu 2011

 

 

marraskuu 2011

2

 

joulukuu 2011

6

Lisätietoja pohjoismaisesta arvostelusta löytyy:

NAVin kotisivut: www.nordicebv.info
Yhteyshenkilö: Gert Pedersen Aamand, Puh. +45 87405288 gap@vfl.dk,

Tanska: www.vfl.dk/nav
Yhteyshenkilö: Ulrik Sander Nielsen, Dansk Kvaeg, Puh. +45 87405289, usn@vfl.dk

Ruotsi: : www.svenskmjolk.se
Yhteyshenkilö: Jan-Åke Eriksson, Svensk Mjölk, Puh. +46 08-790 58 67
jan.eriksson@svenskmjolk.se

Suomi: www.faba.fi
Yhteyshenkilö: Jukka Pösö, Faba, Puh. +358-(0)207472071 jukka.poso@faba.fi

Nordic Cattle Genetic Evaluation